La nef de l’église, l’édifice de style Renaissance tardif le plus important en Suisse, mesure une longueur totale de 60 m et une hauteur de 20 m. L’aménagement est l’oeuvre du P. jésuite Jakob Kurrer. Grâce à la décoration sommaire des bords et des aretes de la voûte, l’apparence est à la fois sobre et impressionnante. La haute nef centrale, les fenêtres latérales de style gothisant, et le renoncement aux stucs sont sans doute encore une réminiscence de l’ancienne église gothique incendiée en 1633. Les autels, les bancs, les stalles du choeur, la chaire et le buffet de l’orgue ont été réalisés par le sculpteur Niklaus Geissler et son atelier. Malgré la diversité des styles, l’intérieur de l’église a une apparence homogène et forme un ensemble harmonieux pour l’oeil.