Die Grosse Hoforgel wurde 1648 geschaffen, im 19. Jahrhundert von Friedrich Haas und 1972/1977 durch Orgelbau Kuhn, Männedorf, erneuert. 5949 Pfeifen verteilen sich auf 84 Register und sind auf Schleifladen in fünf Manualwerke und Pedal gegliedert. Weltweit einzig ist die Regenmaschine im Fernwerk (Dachboden) der Kirche. Die grösste Pfeife ist zehn Meter hoch, wiegt 383 kg und wurde 1648 gegossen.

Von hier aus hat man einen schönen Blick zurück auf die Orgel.